مرکز تحقیقات فن آوری پروتئین دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، به منظور ایفای نقش راهبردی در علم پپتید و پروتئین و با هدف انجام مطالعات مربوط به عملکرد پروتئین ها و اهمیت بیولوژیک آنها در سطح ملکولی و سلولی، انجام تحقیقات در زمینه شیمی و بیوشیمی پپتید‌ها و پروتئین ها (سنتز، تخلیص، تعیین خصوصیات و آنالیز پپتید‌ها و پروتئین‌ها)، مطالعه ساختمان و پایداری پپتیدها و پروتئین‌ها، ساخت و فرمولاسیون ­سیستم‌های متنوع دارورسانی پروتئینی­، تولید فرآورده‌های نوترکیب (زیست فن آوری) و بررسی اثرات فارماکولوژی پپتید‌ها و پروتئین‌ها بنیان گذاری شده است. درخواست اولیه تاسیس این مرکز با همفکری و مشارکت جمعی از اساتید دانشکده داروسازی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی:

• دکتر افشین زرقی، استاد گروه شیمی دارویی
• دکتر علیرضا شفاعتی، استاد گروه شیمی دارویی
• دکتر حمید رضا مقیمی، استاد گروه فارماسیوتیکس
• دکتر حسن یزدان پناه، دانشیار گروه داروشناسی-سم شناسی
• دکتر رضا ابوفاضلی، استاد گروه فارماسیوتیکس

به عنوان اعضای هیات موسس ارائه گردید که پس از تائید توسط شورای دانشگاه در شهریور ماه 1390، در کمیسیون مورخ 17/10/1390 معاونت محترم تحقیقات و فن آوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی نیزمطرح و به تصویب رسید. در راستای همکاری‌های دو جانبه آموزشی و بویژه پژوهشی با دانشکده داروسازی و نیز مشارکت در اجرای پروژه‌های تخصصی و گردآوردن متخصصان و محققان علاقه مند در زمینه پپتید‌ها و پروتئین‌ها در کنار یکدیگر، این مرکز با استقرار در ساختمان دانشکده داروسازی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی فعالیت خود را آغاز نموده است.